Het college is handhavend opgetreden wegens overtreding van de artikelen 3.200 en 3.203, eerste lid onder d in samenhang met artikelen 4.805, 4.820 en 4.833 van het Besluit activiteiten leefomgeving (Bal). Kort gezegd houdt dit in dat het college heeft geconstateerd dat Genuva te veel ammoniak uitstoot. De emissiewaarden van artikel 4.820 van het Bal worden overschreden. Dit kan volgens het college opgelost worden door het aantal dierplaatsen en het aantal te houden dieren te verminderen of door stallen die niet volledig zijn aangesloten op luchtwassers alsnog aan te sluiten op luchtwassers.

Partijen zijn het erover eens dat voor Genuva op basis van het Bal een emissieplafond geldt van 5.043,2 kilogram ammoniak per jaar.
De discussie of er sprake is van een overtreding ligt er vooral in dat het college uitgaat van het aantal dierplaatsen en dat Genuva stelt dat uitgegaan moet worden van het daadwerkelijke aantal dieren. Dierplaatsen veroorzaken immers geen emissie. Dat doen alleen dieren. In de bedrijfsvoering van Genuva staan altijd stallen leeg die schoongemaakt en klaargemaakt moeten worden voor een nieuw koppel varkens. Er zijn altijd minder varkens aanwezig dan vergund.
Het valt daarbij op dat uit de controlerapporten niet blijkt hoeveel dieren er daadwerkelijk zijn en hoe de dierplaatsen zijn vastgesteld. Uit de controlerapporten blijkt ook niet of alle afdelingen bezet zijn. Het vergunde aantal dierplaatsen lijkt te zijn overgenomen uit de omgevingsvergunning die niet in de procedure is overgelegd. Het blijft daarmee onduidelijk hoe de dierplaatsen volgens het college over het bedrijf zijn verdeeld. Ook is onduidelijk of de overtreding niet al op een andere manier, zoals het verminderen van het aantal dieren, is opgeheven.
De vzr. is van oordeel dat het college beter inzichtelijk moet maken hoe hij tot de conclusie komt dat er sprake is van een overtreding. Daarbij mag het college – anders dan Genuva met een beroep op artikel 4.806 van het Bal heeft bepleit – gelet op de tekst in de tabel bij artikel 4.820 Bal in beginsel uitgaan van dierplaatsen in plaats van dieren. Hij moet dit wel nader onderbouwen, met name in relatie tot het beroep op het overgangsrecht (artikel 4.833 van het Bal) dat verzoekster doet.